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樊国梁

2016-07-05 文字:  点击:[]

   

 

   

姓名:樊国梁

职称:教授,博士生导师

beat365官方入口 卓越楼0713

呼和浩特市大学西路235 010021

电话:0471-4993127-6713

传真:471-4993141

Email: eeguoliangfan@sina.com

 

 

 

 

个人简历

教育情况

2009.92013.7内蒙古大学生物物理学专业博士学位

2002.9-2005.7 内蒙古大学电子工程系信号与信息处理专业硕士学位

1993.9-1997.7 内蒙古大学物理系物理学专业学士学位

工作经历

1997.7–现在 内蒙古大学物理系,教授(2018),副教授(2012),讲师(2004)

 

教学

一、曾经主讲的课程

本科生:Fortran语言”,“C语言”,“模拟电路”,“数字电路”,“微机原理与接口技术”,“信号与系统”,“大学物理实验”,“微电子学”

二、目前承担的教学任务

本科生“数字电路与逻辑设计A” (春季学期)、从实验现象看物理(D模块)(秋季学期)、生物信息学导论(秋季学期)

研究生“分子生物物理学”(春季学期)

 

培养研究生情况

每年计划招收硕士研究生2名,博士研究生1

在读研究生:

2023级:李梦洁,2022级:孙建业、裴宏伟,2021级:侯甜甜、董佳琪、董斐雅

毕业研究生:

2020级:桑燕、李金红

2019级:谢茜茜

2018级:顾佳欣、于海青

2017级:石志永、刘芳

2016级:刘渊

2015级:王慧

2014级:刘艳玲

 

研究领域

一、研究方向

生物物理学、生物信息学、大数据与人工智能

二、主持的主要科研项目

1.国家自然科学基金,基于表观遗传修饰数据的肾癌生物标记物挖掘,2021-2024

2. 国家自然科学基金,蛋白质亚线粒体定位及其特征信息和预测算法的挖掘,2015-2018

3.内蒙古自然科学基金,蛋白质亚线粒体定位预测及其算法研究,2013-2015

4.内蒙古自治区高等学校科学研究项目,利用表观遗传修饰数据挖掘肾癌生物标记物,2020-2022

5.内蒙古自治区高等学校科学研究项目,蛋白质亚线粒体定位预测及相关生物学功能关系,2013-2014

三、目前的主要研究方向

1.表观遗传修饰与肿瘤、免疫疾病的相关研究

2.蛋白质亚细胞定位、亚线粒体定位预测及其生物学功能关系

奖励、荣誉和学术兼职

一、获奖和荣誉

1. 2022年,宝钢优秀教师奖;

2. 2017年,内蒙古自治区新世纪321人才工程”人选第二层次;

3. 2013年,内蒙古大学2013年度研究生创新基金《优秀学位论文》奖

4. 2012年,研究生国家奖学金

5. 2008年,内蒙古自治区物理学年会论文奖一等奖

6. 2004年,光华奖学金,二等奖

二、主要学术兼职

1.教育部大学物理教学指导委员会大学物理实验专委会委员

2.教育部大学物理教学指导委员会文科物理类专委会委员

3.全国高等学校实验物理研究会理事

4.虚拟仿真实验教学创新联盟电子信息专业类工作委员会委员

5.内蒙古自治区高校实验物理专委会主任

6.内蒙古自治区物理学会理事

7.内蒙古自治区生物物理与生物信息学会理事

主要论著

1. 董斐雅,侯甜甜,董佳琪,张晓炜*,刘暘,樊国梁*. 系统性红斑狼疮受DNA甲基化影响的关键基因分析. 生物物理学, 2024, 12(1), 9-21.

2. 侯甜甜,董斐雅,董佳琪,张晓炜,刘暘,樊国梁*. 基于生物信息学和机器学习筛选类风湿关节炎关键基因. 内蒙古大学学报(自然科学版), 2024, 55 (01):38-45.

3. 谢茜茜,张晓炜,刘暘,樊国梁*.急性髓系白血病中受组蛋白修饰和DNA甲基化影响的关键基因分析. 内蒙古大学学报(自然科学版), 2022, 53 (06):611-620.

4. Sun CZ, Feng YE* and Fan GL*. IDPsBind: a repository of binding sites for intrinsically disordered proteins complexes with known 3D structures. BMC Molecular and Cell Biology, (2022) 23:33-36.

5. 彭宝成, 张晓炜*,刘暘,樊国梁*. 基于CNN 的大肠杆菌启动子预测. Prog. Biochem. Biophys. 2021, 48(12): 1136-1143.

6. 顾佳欣, 于海青,樊国梁*.头颈部鳞状细胞癌差异表达基因分析. 内蒙古大学学报(自然科学版), 2021, 52 (02):52-60.

7. 于海青, 顾佳欣,樊国梁*.宫颈癌分子调控机制的关键基因分析. 内蒙古大学学报(自然科学版), 2021, 52 (01):49 58.

8. Zhang LQ, Fan GL, Liu JJ, Liu L, Li QZ* and Lin H*. Identification of Key Histone Modifications and Their Regulatory Regions on Gene Expression Level Changes in Chronic Myelogenous Leukemia. Frontiers in Cell and Developmental Biology. 2021, 8:1735.

9. Zhang LQ, Liu JJ, Liu L, Fan GL, Li YN and Li QZ*. The impact of gene-body H3K36me3 patterns on gene expression level changes in chronic myelogenous leukemia. Gene, 802 (2021) 145862.

10. Wang H, Liu Y and Fan GL*. The Regulation of target genes by co-occupancy of transcription factor c-Myc, Mxi1 with Max in the mouse cell line. Current Bioinformatics, 2020, 15(6):547-555.

11. Wu CY*, Li QZ, Xing R, Fan GL. Using the Chou’s Pseudo Component to Predict the ncRNA Locations Based on the Improved K-nearest Neighbor (iKNN) Classifier. Current Bioinformatics. 2020, 15(6): 582 – 592.

12. Liu F, Liu Y, Wang H, Fan GL*. Identification of survival and main function in kidney renal clear cell carcinoma, Basic Clinical Pharmacology Toxicology, 2019, 137(s1):87-88.

13. Wang H, Liu YL, Liu Y, Yan X, Fan GL*, Zhang XW. The correlation between co-occupancy patterns of transcription factors with histone modification and dNase I in the mouse cell line, Basic Clinical Pharmacology Toxicology, 2018, 123(s1):82-83.

14. Fan GL*, Liu YL, Wang H. Identification of thermophilic proteins by incorporating evolutionary and acid dissociation information into Chou's general pseudo amino acid composition. J. THEOR. BIOL., 2016, 407(2016):138–142.

15. Su WX, Li QZ, Zhang LQ, Fan GL, Wu CY, Yan ZH. Gene expression classification using epigenetic features and DNA sequence composition in the human embryonic stem cell line H1. Gene, 2016:227-234.

16. Fan GL*, Zhang XY, Liu YL, Nang Y, Wang H. DSPMP: Discriminating Secretory Proteins of Malaria Parasite by Hybridizing Different Descriptors of Chou’s Pseudo Amino Acid Patterns. J. Comput. Chem. 2015, 362317–2327.

17. 曩毅,梅含雪,赵燕,侯宝妍,赵志远,樊国梁*. 基于Blast GO 的蛋白质亚线粒体定位预测. Prog. Biochem. Biophys. 2015, 42(12): 1136-1143.

18. Zuo YC*, Lv Y, Wei ZY, Yang L, Li GP, Fan GL*, iDPF-PseRAAAC: A Web-Server for Identifying the Defensin Peptide Family and Subfamily Using Pseudo Reduced Amino Acid Alphabet Composition. PLOS ONE, 2015, 10(12): e0145541.

19. Fan GL*, Liu YL, Zuo YC*, Mei HX, Rang Y, Hou BY, Zhao Y, acACS: Improving the Prediction Accuracy of Protein Subcellular Locations and Protein Classification by Incorporating the Average Chemical Shifts Composition. The Scientific World Journal, 2014, 2014, ID 864135.

20. Zuo YC*, Peng Y, Liu L, Chen W, Yang L, Fan GL*, Predicting peroxidase subcellular location by hybridizing different descriptors of Chou’ pseudo amino acid patterns. Anal BioChem, 2014, 458(2014):14-19.

21. Fan GL*, Li QZ, Zuo YC, Predicting acidic and alkaline enzymes by incorporating the average chemical shift and gene ontology informations into the general form of Chou's PseAAC[J]. Process Biochemistry, 2013,48(7):1048–1053.

22. Fan GL*, Li QZ, Discriminating bioluminescent proteins by incorporating average chemical shift and evolutionary information into the general form of Chou's pseudo amino acid composition [J]. J. THEOR. BIOL., 2013, 334(2013):45–51.

23. Li T, Li QZ, Liu S, Fan GL, Zuo YC, Peng Y, PreDNA: accurate prediction of DNA-binding sites in proteins by integrating sequence and geometric structure information, Bioinformatics, 2013, 29(2013):678-685.

24. Zuo YC, Chen W, Fan GL, Li QZ, A similarity distance of diversity measure for discriminating mesophilic and thermophilic proteins. Amino Acids, 2013, 44(2013):573-580.

25. Fan GL*, Li QZ, Predicting protein submitochondria locations by combining different descriptors into the general form of Chou's pseudo amino acid composition. [J].Amino Acids, 2012, 43(2012):545–555.

26. Fan GL*, Li QZ, Predict mycobacterial proteins subcellular locations by incorporating pseudo-average chemical shift into the general form of Chou's pseudo amino acid composition. [J]. J. THEOR. BIOL., 2012, 304(2012):88–95.

27. Fan GL*, Li QZ, Yang KL, TFBSs: a web server for predicting transcription factor binding sites. 2012 IEEE International Conference on Cyber Technology in Automation, Control and Intelligent Systems (CYBER), 2012, 1:65-68 .

28. Na R, Fan GL, Effect of the Corona Discharge on Peel Microstructure. 2011 International Conference on Materials for Renewable Energy & Environment[C]. Shanghai, China IEEE2011, 1:2014-2017.

29. Fan GL, Li QZ, Predicting Protein Submitochondrion Location Using Pseudo-Average Chemical Shift and Hybrid Approach. International Biophysics Congress (17th IBC), 2011.

30. 樊国梁,张晓燕.自动跟踪太阳时角提高光伏发电效率[J].内蒙古大学学报, 2010,41(1): 116-119.

31. 刘利,李前忠,樊国梁.低维输入空间的支持向量机识别人类剪接位点[J].生物物理学报,2008,24(1):49-56.

32. 陈颖丽,李前忠,樊国梁,杨科利.基于支持向量机的多类凋亡蛋白亚细胞位置预测[J],内蒙古大学学报, 2008, 39(2): 159-165.

33. 樊国梁,白凤山.EPP模式的DSP仿真器设计[J].内蒙古大学学报,2008, 39(3): 342-345.

34. 陈颖丽,李前忠,杨科利,樊国梁.基于离散增量结合支持向量机方法的凋亡蛋白亚细胞位置预测[J].生物物理学报2007,23(3):192-198.

35. 杨乌日吐,李前忠,刘利,樊国梁.用支持向量机预测人类基因5′/3′选择性剪切位点[J].现代生物医学进展,2007,7(5):790-795.

36. 樊国梁,白凤山.基于DSP的频谱分析仪设计[J].内蒙古大学学报,2006, 37(4): 450-454.

37. 樊国梁.基于VHDL的键盘扫描及显示电路设计[J].电子世界, 2005, 26(2): 25-26.

38. 樊国梁.VHDL语言设计数字电路[J].国外电子测量技术,2005,24(2):46-48.

39. 樊国梁.客户/服务器应用程序设计[J].国外电子测量技术,2004,23(3):35-36.

40. 樊国梁.电话线防盗系统[J].电子世界,2004,25(6):58-60.

41. 樊国梁.DELPHI中高精度时钟控件的设计[J].国外电子测量技术,2003, 22(6): 33-35.

42. 樊国梁.一种月、季气候资料的处理使用方法[J].内蒙古气象, 2003, 48(4): 30-34.

43. 樊国梁.在DELPHI中创建动态链接库DLL[J].教学科研管理论文集,2002,6(1):31-33.

 

本科教学成果

一、主持的主要教学项目

1. 主持,液晶空间光调制器系列实验师资培训,2021年教育部产学合作协同育人项目,2020.11-2021.12

2. 主持,内蒙古大学物理仿真实验平台建设,2020年教育部产学合作协同育人项目,2020.11-2021.12

3. 主持,“大学物理实验”课程教学模式、教学内容、教学方法和教学手段的研究,教育部高等学校教学研究项目,2015.1-2016.12

4. 核心成员,单晶硅太阳电池制备参数优化虚拟仿真实验项目,2019年首批国家一流课程

5. 主要成员,面向少数民族地区在物理学科助力下电子科学与技术专业升级探索与实践,教育部第二批新工科研究与实践项目,2020.09-2022.09

6. 主持,硅基光波导的制备工艺优化虚拟仿真实验,2020年第二批内蒙古自治区一流课程

7. 主持,依托国家一流课程建设自治区物理虚拟仿真实验共享中心,内蒙古自治区高等学校教学改革科学研究项目(重点),2022.12-2023.12

8. 主持,大学物理实验数字化教材,内蒙古自治区高等学校教学改革科学研究项目,2019.12-2020.12

9. 主持,基于虚拟仿真实验创新大学物理实验教学模式与实验室建设,内蒙古自治区高等学校教学改革科学研究项目,2015.12-2017.12

10. 主持,大学物理实验数字化教材,内蒙古大学本科教学改革研究与建设项目,2020-2022

11. 主持,近代物理实验,内蒙古大学2020 年第二批校级线上一流本科课程建设(线上)项目,2020-2021

12. 主持,数字电路与逻辑设计,内蒙古大学第三批课程思政示范课建设项目,2020-2023

13. 主持,近代物理实验,内蒙古大学主干核心课程建设项目,2019-2022

14. 主持,数字电路与逻辑设计,内蒙古大学主干核心课程建设项目,2019-2022

15. 主持,从实验现象看物理(D),内蒙古大学第二批通识教育选修课,2016.3-2022.10

二、教学成果奖

1. 2022年,优势物理学基础推进电子科学与技术专业新工科建设的教改与实践,内蒙古自治区高等教育教学成果一等奖;

2. 2018年,国家特色物理学专业建设与创新人才培养,内蒙古自治区高等教育教学成果一等奖;

3. 2016年,内蒙古大学校创优秀指导教师;

4. 2013年,基地物理实验教学与管理的理论研究与实践,内蒙古大学高等教育教学成果二等奖;

5. 2009年,物理实验教学与管理的理论研究与实践,内蒙古大学高等教育教学成果三等奖;

6. 2009年,数字信号处理及嵌入式开发系统,全国电子信息实践教学成果二等奖;

三、教学论文

1. 朱俊,刘利,哈斯花,樊国梁. 虚实结合的校外共享实习基地研究初探——以电子科学与技术专业为例. 新型工业化, 2020,10(4):109-111

2. 樊国梁. 分层次、多模块体系. 物理实验,2017,37(3):36

3. Fan GL, Na R, Liu JJ. The formation, development and Practice on Excellent Course of College Physics ExperimentICEMSS20142014.

4. Fan GL, Na R, Liu JJ. The design of College physics experiment network testing systemICEMSS20142014.

5. 樊国梁,那日,刘俊杰.大学物理实验精品课程建设思路与探索.2013年高等院校教育与教学研讨会, 2013

6. 樊国梁,张晓燕,曹杰.基于FPGA的保密型密码输入器设计[J].电子技术应用, 2009,35(5): 66-69

7. 樊国梁,那日,刘俊杰.物理实验中心现代化管理及运行机制研究应用,2008年第二届内蒙古青年学术论坛物理学科分会暨内蒙古物理学会年会,2008

8. 樊国梁.开放式大学物理实验网络选课系统设计与应用[J].高等理科教育, 2007, 13(6):101-103

四、编写教材

1.主编,大学物理实验,高等教育出版社,2015

2.主编,大学物理实验,内蒙古大学出版社,2008

3.副主编,近代物理实验,内蒙古大学出版社,2018

4.副主编,大学物理,上海交通大学出版社,2018

五、指导学科技能竞赛情况

1. 2023年第九届全国大学生物理实验竞赛二等奖,指导教师

2. 2021年第七届全国大学生物理实验竞赛二等奖,指导教师

3. 2023年第九届全国大学生物理实验竞赛三等奖,指导教师

4. 2021年第七届全国大学生物理实验竞赛三等奖,指导教师

5. 2019年第五届全国大学生物理实验竞赛三等奖,指导教师

六、指导本科生发表论文

1.彭宝成,樊国梁*. 基于CNN 的大肠杆菌启动子预测. Prog. Biochem. Biophys., 2022, 49(7): 1334-1347.

2.曩毅,樊国梁*. 基于Blast GO 的蛋白质亚线粒体定位预测. Prog. Biochem. Biophys., 2015, 42(12): 1136-1143.

3.曹杰,樊国梁基于FPGA的保密型密码输入器设计[J]电子技术应用, 2009,35(5): 66-69.

 

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